Al Kaida wyznaczyła na swojego nowego przywódcę Ajmana az-Zawahiriego. Ten pochodzący z Egiptu chirug, bliski współpracownik Osamy bin Ladena, był uważany za człowieka numer dwa siatki. Analitycy wskazują Ajmana az-Zawahiriego jako głównego organizatora działalności Al Kaidy i "mózg" byłego przywódcy Osamy bin Ladena.

        Az-Zawahiri i bin Laden poznali się w połowie lat 80 - tych w pakistańskim Peszawarze, gdzie obaj wspierali bojowników, walczących w Afganistanie przeciwko Związkowi Radzieckiemu. Wtedy zaczęła się ich trwająca blisko 30 lat współpraca.

         Urodzony w 1951 roku w Egipcie Ajman az-Zawahiri był synem profesora farmacji i wnukiem wielkiego imama Al-Azhar, najwyższego przywódcy religijnego islamskich sunnitów. Po ukończeniu najbardziej prestiżowego uniwersytetu medycznego w Egipcie ze specjalizacją drugiego stopnia z chirurgii, związał się z Bractwem Muzułmańskim, dążącym do powołania państwa islamskiego, potem wstąpił też do organizacji terrorystycznej Egipski Islamski Dżihad. Był także zamieszany w ataki na ambasady USA w Kenii i Tanzanii. W 1999 roku egipski sąd skazał go za działalność terrorystyczną zaocznie na karę śmierci.

         Według doniesień, żona i córki az-Zawahiriego zginęły w 2001 roku podczas bombardowania  w afgańskim Kandaharze.

         Ajman az-Zawahiri był znany między innymi z częstych wystąpień w internecie, gdzie w nagraniach wideo groził światowi zachodniemu dżihadem.

         Nowy szef Al Kaidy zapowiedział, że będzie kontynuował dżihad przeciwko Stanom Zjednoczonym i Izraelowi oraz tym, którzy ich popierają. Wezwał też muzułman do walki przeciwko "najeźdźcy".

PP